通过体内和体外的实验观察证明,壳寡糖随着分子量的升高,吸收的效率降低。并且观察到分子量为3.8KDa的壳寡糖比分子量为230KDa的可溶性壳聚糖吸收效率提高了23~25倍 。研究发现壳寡糖的吸收与壳寡糖分子量紧密相关,分子量越大的壳寡糖穿过上皮细胞间隙时越困难。
壳寡糖口服后很快进入血液,并且血液中监测壳寡糖的量在1小时内即可达到最高值。而对于可溶性壳聚糖来说,由于其分子量要高于壳寡糖分子,因此在血液中所能达到的最大血药浓度要小于壳寡糖,并且达到最大血药浓度的时间也比壳寡糖要有所推后。壳寡糖进入体内后迅速进入各个器官中,其中在肝脏中的浓度较其他组织中要高。在肾脏,脾 脏,肺,淋巴等器官中也都发现有壳寡糖的分布。这也是壳寡糖在机体内产生诸多的生理活性的基本前提。